Capsid

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Ein capsid ist die Protein-Schale eines Virus. Es besteht aus mehreren oligomeric aus genanntem protomers des Proteins gemachten Struktursubeinheiten. Die erkennbaren 3-dimensionalen morphologischen Subeinheiten, die können oder individuellen Proteinen nicht entsprechen können, werden capsomeres genannt. Der capsid schließt das genetische Material des Virus ein.

Capsids werden gemäß ihrer Struktur weit gehend klassifiziert. Die Mehrheit von Viren hat capsids entweder mit der spiralenförmigen oder mit icosahedral Struktur. Einige Viren, wie bacteriophages, haben mehr komplizierte Strukturen wegen Einschränkungen der Elastizität und Elektrostatik entwickelt. Die Icosahedral-Gestalt, die 20 gleichseitige Dreiecksgesichter hat, kommt einem Bereich näher, während die spiralenförmige Gestalt zylindrisch ist. Die Capsid-Gesichter können aus einem oder mehr Proteinen bestehen. Zum Beispiel hat das Virus der Mund- und Klauenseuche capsid Gesichter, die aus drei Proteinen genannt VP1-3 bestehen.

Einige Viren werden eingewickelt, bedeutend, dass der capsid mit einer lipid als der Virenumschlag bekannten Membran angestrichen wird. Der Umschlag wird durch den capsid von einer intrazellulären Membran im Gastgeber des Virus erworben; einige Beispiele würden die innere Kernmembran, die golgi Membran und die Außenmembran der Zelle einschließen.

Sobald das Virus die Zelle angesteckt hat, wird es anfangen, sich mit den Mechanismen der angesteckten Gastgeber-Zelle zu wiederholen. Während dieses Prozesses werden neue capsid Subeinheiten gemäß dem genetischen Material des Virus mit dem Protein-Biosynthese-Mechanismus der Zelle synthetisiert. Während des Zusammenbau-Prozesses wird eine Pfortsubeinheit an einem Scheitelpunkt des capsid gesammelt. Durch diese Pfort-, Viren-DNA oder RNS wird in den capsid transportiert.

Strukturanalysen von Architekturen des capsid Hauptproteins (MCP) sind verwendet worden, um Viren in Familien zu kategorisieren. Zum Beispiel sind die bacteriophage PRD1, Paramecium bursaria Virus von Chlorella algal und Säugetieradenovirus in dieselbe Familie gelegt worden.

Triangulationszahl

Virus von Icosahedral capsids wird normalerweise eine Triangulationszahl (T-Zahl) zugeteilt, um die Beziehung zwischen der Zahl des Pentagons und den Sechsecken d. h. ihrer Quasisymmetrie in der Capsid-Schale zu beschreiben. Die T-Zahl-Idee wurde ursprünglich entwickelt, um die Quasisymmetrie durch Caspar und Klug 1962 zu erklären.

Zum Beispiel, rein icosahedral Virus hat eine T-Zahl 1 (gewöhnlich schriftlich, T=1), und ein gestutztes Ikosaeder wird T=3 zugeteilt. Die T-Zahl wird durch (1) Verwendung eines Bratrostes zur Oberfläche des Virus mit Koordinaten h und k, (2) berechnet, die Zahl von Schritten zwischen dem aufeinander folgenden Pentagon auf der Virus-Oberfläche, (3) Verwendung der Formel aufzählend:

: =

wo und h und k die Entfernungen zwischen dem aufeinander folgenden Pentagon auf der Virus-Oberfläche für jede Achse sind (sieh Figur auf Recht). Die größeren die T-Zahl mehr Sechsecke sind hinsichtlich des Pentagons da.

T-Zahlen können unterschiedlich vertreten werden, zum Beispiel kann T=1 nur als ein Ikosaeder oder ein Dodekaeder vertreten werden und, je nachdem der Typ der Quasisymmetrie, T=3 als ein gestutztes Dodekaeder, ein icosidodecahedron, oder ein gestutztes Ikosaeder und ihr jeweiliger duals ein triakis Ikosaeder, ein rhombischer triacontahedron oder ein pentakis Dodekaeder präsentiert werden kann.


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