NAMD

NAMD (Nicht (gerade) ein Anderes Molekulares Dynamik-Programm) ist ein kostenloses molekulares Dynamik-Simulierungspaket das schriftliche Verwenden des Charmes ++ paralleles Programmiermodell, das für seine parallele Leistungsfähigkeit bemerkt ist und häufig verwendet ist, um große Systeme (Millionen von Atomen) vorzutäuschen. Es ist durch die gemeinsame Kollaboration von Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) und Parallel Programming Laboratory (PPL) an der Universität Illinois an Urbana-Champaign entwickelt worden.

Es wurde 1995 von Nelson eingeführt u. a. als ein paralleler molekularer Dynamik-Code, der interaktive Simulation durch die Verbindung zur Vergegenwärtigung ermöglicht, codieren VMD. NAMD ist seitdem reif geworden, viele Eigenschaften hinzufügend und zu Tausenden von Verarbeitern kletternd.

Die letzte stabile Version (bezüglich des Mais 2011) ist 2.8.

Siehe auch

  • Liste der Software für die molekulare Mechanik, modellierend
  • VMD
  • Charme ++

Außenverbindungen


GROMACS / Baruch
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