Die Maus von Allen und Gehirnatlasse sind Projekte innerhalb des Instituts von Allen für die Gehirnwissenschaft, die sich bemühen, genomics mit der Neuroanatomie durch das Schaffen von Genausdruck-Karten für die Maus und das menschliche Gehirn zu verbinden. Sie wurden im September 2003 mit einer Spende von $ 100 Millionen von Paul G. Allen begonnen, und der erste Atlas ist im September 2006 in eine Aktiengesellschaft umgewandelt worden.

, sieben Gehirnatlasse sind veröffentlicht worden: Maus-Gehirnatlas, Menschlicher Gehirnatlas, Maus-Gehirnatlas Entwickelnd, Menschlichen Gehirnatlas, Maus-Konnektivitätsatlas, Nichtmenschlichen Primat-Atlas und Maus-Rückenmark-Atlas Entwickelnd. Es gibt auch drei zusammenhängende Projekte mit Datenbanken: Glioblastoma, Maus-Ungleichheit und Schlaf. Es ist die Hoffnung auf das Institut von Allen, dass ihre Ergebnisse helfen werden, verschiedene Felder der Wissenschaft, besonders diejenigen vorzubringen, die das Verstehen von neurobiological Krankheiten umgeben.

Geschichte

2001 hat Paul Allen eine Gruppe von Wissenschaftlern, einschließlich James Watsons und Steven Pinkers gesammelt, um die Zukunft von neuroscience zu besprechen, und was getan werden konnte, um neuroscience Forschung (Jones 2009) zu erhöhen. Während dieser Sitzungen hat David Anderson vom Institut von Kalifornien für die Technologie die Idee vorgeschlagen, dass ein dreidimensionaler Atlas des Genausdrucks im Maus-Gehirn von großem Nutzen zur neuroscience Gemeinschaft sein würde. Das Projekt wurde 2003 mit einer Spende von 100 Millionen Dollar von Allen durch das Institut von Allen für die Gehirnwissenschaft in Gang gesetzt.

Das Projekt hat eine Technik verwendet, um Genausdruck kartografisch darzustellen, der von Gregor Eichele und Kollegen am Institut von Max Planck in Hannover, Deutschland entwickelt ist. Die Technik hat Genausdruck mit colorimetric in der situ Kreuzung kartografisch dargestellt, um Genausdruck kartografisch darzustellen. Das Projekt hat ein 3-jähriges Ziel gesetzt, das Projekt zu beenden und es zum Publikum bereitzustellen.

Eine anfängliche Ausgabe des Produktes zum Publikum ist im Dezember 2004 vorgekommen. Nachher, mehr Daten wurde etappenweise veröffentlicht. Die weite Genom Enddatei wurde im September 2006 veröffentlicht. Jedoch war die Endausgabe des Atlasses nicht das Ende des Projektes; der Atlas wird noch übertroffen. Außerdem werden andere Projekte einschließlich des menschlichen Gehirnatlasses, Maus-Gehirn entwickelnd, menschliches Gehirn, Maus-Konnektivität, nichtmenschlichen Primat-Atlas und den Maus-Rückenmark-Atlas entwickelnd, durch das Institut von Allen für die Gehirnwissenschaft in Verbindung mit dem Gehirnatlas von Allen Mouse entwickelt.

Absichten für das Projekt

Die sich überwölbende Absicht und Devise für alle Institutprojekte von Allen liefern Entdeckung "Brennstoff". Das Projekt müht sich, diese Absicht und Fortschritt-Wissenschaft auf einige Weisen zu erfüllen. Erstens schaffen sie Gehirnatlasse, um die Verbindungen zwischen Genen und Gehirnwirkung besser zu verstehen. Sie haben zum Ziel, die Forschung und Kenntnisse über neurobiological Krankheiten wie Parkinson, Alzheimer, und Autismus damit vorzubringen, dass sie des Genausdrucks überall im Gehirn kartografisch darstellen.

Die Gehirnatlas-Projekte folgen auch der "Allen" Institutdevise mit ihrer offenen Ausgabe von Daten und Ergebnissen. Diese Politik ist auch mit einer anderen Absicht des Instituts verbunden: zusammenarbeitende und mehrdisziplinarische Forschung. So ist jeder Wissenschaftler von jeder Disziplin im Stande, auf die Ergebnisse zu schauen und sie in Betracht zu ziehen, während er ihre eigenen Experimente entwirft. Auch verfügbar für das Publikum ist die Gehirnforscher-Anwendung.

Forschungstechniken

Das Institut von Allen für die Gehirnwissenschaft verwendet eine projektbasierte Philosophie für ihre Forschung. Jeder Gehirnatlas konzentriert sich auf sein eigenes Projekt, das aus seiner eigenen Mannschaft von Forschern zusammengesetzt ist. Um einen Atlas zu vollenden, sammelt jede Forschungsmannschaft und synthetisiert Gehirnansehen, medizinische Daten, genetische Information und psychologische Daten. Mit dieser Information sind sie im Stande, die 3. biochemische Architektur des Gehirns zu bauen und sich zu belaufen, welche Proteine in bestimmten Teilen des Gehirns ausgedrückt werden. Um die erforderlichen Daten zu sammeln, verwenden Wissenschaftler am Institut von Allen verschiedene Techniken. Eine Technik ist mit dem Gebrauch des Leichenverstands und der Gehirnabtastungstechnologie verbunden, um zu entdecken, wo in den Gehirngenen angemacht werden und davon. Eine andere Technik, herbeigerufen situ Kreuzung oder ISH, wird verwendet, um Genausdruck-Muster als in situ Kreuzungsimages anzusehen.

Innerhalb der Gehirnatlasse offenbaren diese 3. ISH Digitalimages und Graphen, in der Farbe, die Gebiete, wo ein gegebenes Gen ausgedrückt wird. Im Gehirnforscher kann nach jedem Gen gesucht und ausgewählt werden, im situ Image hinauslaufend, das als eine leicht manipulierte und erforschte Mode erscheint. Ein Teil der Entwicklung dieser Anatomie - Datenbank des Genausdrucks, schließt das Übereinstimmen ISH Daten für jedes Gen mit einem dreidimensionalen Koordinatenraum durch die Registrierung mit einem für das Projekt geschaffenen Bezugsatlas ein.

Beiträge zu neuroscience

Die verschiedenen Typen von Zellen im Zentralnervensystem entstehen aus dem unterschiedlichen Genausdruck. Eine Karte des Genausdrucks im Gehirn erlaubt Forschern, Formen und Funktionen aufeinander zu beziehen. Der Atlas von Allen Brain lässt Forscher die Gebiete des sich unterscheidenden Ausdrucks im Gehirn ansehen, das die Betrachtung von Nervenverbindungen überall im Gehirn ermöglicht. Die Betrachtung dieser Pfade durch den sich unterscheidenden Genausdruck sowie die funktionellen Bildaufbereitungstechniken erlaubt Forschern, zwischen dem Genausdruck, den Zelltypen und der Pfad-Funktion in Bezug auf Handlungsweisen oder Phänotypen zu entsprechen.

Wenn auch die Mehrheit der Forschung in Mäusen getan worden ist, haben 90 % von Genen in Mäusen eine Kopie in Menschen. Das macht den Atlas besonders nützlich, um Krankheiten zu modellieren. Die Genausdruck-Muster in normalen Personen stellen einen Standard zur Verfügung, um veränderte Phänotypen zu vergleichen und zu verstehen. Das Verlängern der von Maus-Krankheiten erfahrenen Information wird besser dem Verstehen von menschlichen neurologischen Unordnungen helfen. Der Atlas kann sich zeigen, welche Gene und besondere Gebiete in neurologischen Unordnungen bewirkt werden; die Handlung eines Gens in einer Krankheit kann in Verbindung mit allgemeinen Ausdruck-Mustern und dem bewertet werden Daten konnten Licht auf die Rolle des besonderen Gens in der Unordnung werfen.

Gehirnforscher

Die Atlas-Website von Allen Brain enthält einen herunterladbaren 3. interaktiven Forscher von Brain. Der Forscher ist im Wesentlichen ein Suchmotor für Positionen des Genausdrucks; das ist in der Entdeckung von Gebieten besonders nützlich, die ähnliche Gene ausdrücken. Benutzer können Netze und Pfade mit dieser Anwendung skizzieren, indem sie Gebiete dass Co-Schnellzug ein bestimmtes Gen verbinden. Der Forscher verwendet eine vielfarbige Skala und enthält vielfache Flugzeuge des Gehirns, die Zuschauer Unterschiede in der Dichte und dem Ausdruck-Niveau sehen lassen. Die Images sind eine Zusammensetzung von vielen durchschnittlichen Proben, so ist es nützlich, wenn man sich mit Personen mit dem anomal niedrigen Genausdruck vergleicht.

Atlasse

Maus-Gehirn

Der Atlas von Allen Mouse Brain ist eine umfassende weites Genom Karte des erwachsenen Maus-Gehirns, das offenbart, wo jedes Gen ausgedrückt wird. Der Maus-Gehirnatlas war das ursprüngliche Projekt des Atlasses von Allen Brain und wurde 2006 beendet. Der Zweck des Atlasses ist, in der Entwicklung der neuroscience Forschung zu helfen. Die Hoffnung auf das Projekt besteht darin, dass es Wissenschaftlern erlauben wird, ein besseres Verstehen von Gehirnkrankheiten und Unordnungen wie Autismus und Depression zu gewinnen.

Menschliches Gehirn

Der Gehirnatlas von Allen Human wurde im Mai 2010 bekannt gegeben. Es war die erste anatomisch und genomically umfassende dreidimensionale menschliche Gehirnkarte.. Der Atlas wurde geschaffen, um Forschung in vielen neuroscience Forschungsfeldern einschließlich neuropharmacology, menschlicher Gehirnbildaufbereitung, menschlichen generics, Neuroanatomie, genomics und mehr zu erhöhen. Der Atlas wird auch zur Förderung der Forschung in Unordnungen der psychischen Verfassung und Gehirnverletzungen wie Alzheimer, Autismus, Schizophrenie und Drogenabhängigkeit eingestellt.

Das Entwickeln des Maus-Gehirns

Der Maus-Gehirnatlas von Allen Developing ist ein Atlas, der Genausdruck während der Entwicklung eines C57BL/6 Maus-Gehirns verfolgt. Das Projekt hat 2008 begonnen und ist zurzeit andauernd. Der Atlas basiert von der Kernspinresonanz-Bildaufbereitung (MRI). Es verfolgt das Wachstum, die weiße Sache, die Konnektivität und die Entwicklung des C57BL/6 Maus-Gehirns vom embryonischen Tag 12 zum postnatalen Tag 80.

Dieser Atlas erhöht die Fähigkeit von neuroscientists zu studieren, wie Schadstoffe und genetische Veränderungen die Entwicklung des Gehirns bewirken. So kann der Atlas verwendet werden, um zu bestimmen, welche Toxine spezielle Bedrohung für Kinder und schwangere Mütter darstellt.

Maus-Gehirnkonnektivität

Der Gehirnkonnektivitätsatlas von Allen Mouse wurde im November 2011 gestartet. Verschieden von anderen Atlassen vom Institut von Allen konzentriert sich dieser Atlas auf die Identifizierung des Nervenschaltsystemes, die Verhalten und Gehirnfunktion regeln. Dieses Nervenschaltsystem ist für Funktionen wie Verhalten und Wahrnehmung verantwortlich. Diese Karte wird Wissenschaftlern erlauben, weiter zu verstehen, wie das Gehirn arbeitet, und was Gehirnkrankheiten und Unordnungen, wie die Parkinsonsche Krankheit und Depression verursacht.

Maus-Rückenmark

Entschleiert im Juli 2008 war der Rückenmark-Atlas von Allen Mouse die erste weite Genom Karte des jemals gebauten Maus-Rückenmarks. Der Rückenmark-Atlas ist eine Karte des Genoms breiter Genausdruck im Rückenmark von erwachsenen und jugendlichen C57 schwarzen Mäusen. Die Initiale, die sich entschleiert, hat Daten für 2,000 Gene und eine anatomische Bezugsabteilung eingeschlossen. Ein Plan für die Zukunft schließt Erweiterung der Datenmenge zu ungefähr 20,000 Genen ein, die die volle Länge des Rückenmarks abmessen.

Das Ziel des Rückenmark-Atlasses ist, Forschung in der Behandlung der Rückenmark-Verletzung, Krankheiten und Unordnungen wie die Krankheiten von Lou Gehrig und Rückgratmuskelatrophie zu erhöhen. Das Projekt wurde durch eine Reihe von Spendern einschließlich des Forschungsinstituts von Allen, Gelähmten Veteran des Forschungsfundaments von Amerika, der ALS Vereinigung, der Forschung von Wyeth, der PEMCO Versicherung, der nationalen Gesellschaft der Multiplen Sklerose, des Internationalen Rückgratforschungsvertrauens, und vieler anderer Organisationen, der Fundamente, der korporativen und privaten Spender gefördert.

Siehe auch

• Liste von neuroscience Datenbanken
• EMAGE, der E-Maus-Atlas des Genausdrucks
• Pawel K. Olszewski, "Analyse des Netzes, neuroregulators das Verwenden des Atlasses von AllenBrain" Neuroscience des Verhaltens, 2009 am 1. Januar zu füttern.
• Robert Lee Hotz, "Die Mysterien des Gehirns" Das Wall Street Journal am 24. Januar 2012 untersuchend.
• Allan Jones, "Der Atlas von Allen Brain: 5 Jahre und darüber hinaus", Natur, 2009. doi:10.1038/nrn2722.

Links

• Gehirnatlas von Allen
• "Neuer Gehirnatlas Entschleiert 3. Genkarte", Artikel ABC News am 2006-09-26.