In der Biochemie beschreibt die Membranentopologie eines transmembrane Proteins, welche Teile der Aminosäure-Folge des Proteins innerhalb des Flugzeugs der Umgebung lipid bilayer liegen, und welche Teile in die wässerige Umgebung auf beiden Seiten hervortreten. Mehr kurz und bündig beschreibt die Membranentopologie, welche Gebiete der polypeptide Kette die Membran abmessen.

Beschreibung

Weil Biochemiker den hydrophobicity von Aminosäuren individuell, der Membranentopologie eines Proteins wissen (und tatsächlich ob es ein integriertes Membranenprotein an erster Stelle ist), häufig kann genau auf der Grundlage von einer Folge eines Proteins allein vorausgesagt werden (der natürlich der Reihe nach allein von der nucleotide Folge eines Gens vorausgesagt werden kann). Solche Vorhersagen basieren am meisten zuverlässig in der Annahme, dass der lipid das Bilayer-Überspannen von Teilen eines transmembrane Proteins eine mit dem Alpha spiralenförmige sekundäre Struktur annehmen wird.

Da Membranentopologie oft die erste verfügbare Strukturinformation über ein Protein ist, nachdem sequencing integrierte Membranenproteine häufig klassifiziert oder gemäß dieser Eigenschaft gruppiert werden. Im Klassifizieren von Proteinen auf diese Weise schauen Biologen auf die Zahl von Zeiten die peptide Kette wird vorausgesagt, um die Membran zu durchqueren, und kann tatsächlich eine Klasse auf dieser Basis (z.B "7TM Empfänger") nennen.

Membranentopologie-Vorhersagen können auch unschätzbar sein, um Antikörper, Rauschgifte oder andere Reagenzien zu entwickeln, die binden und/oder die Funktion des Proteins betreffen werden.