Gebiet von Transmembrane zeigt gewöhnlich eine einzelne transmembrane Alpha-Spirale eines transmembrane Proteins an. Es wird ein "Gebiet" genannt, weil sich eine Alpha-Spirale in einer Membran unabhängig vom Rest des Proteins falten kann, das Gebieten von wasserlöslichen Proteinen ähnlich ist. Weit gehender ist ein transmembrane Gebiet jede dreidimensionale Protein-Struktur, die in einer Membran thermodynamisch stabil ist. Das kann eine einzelne Alpha-Spirale, ein stabiler Komplex von mehrerem transmembrane Alpha helices, einem transmembrane Beta-Barrel, einer Beta-Spirale von gramicidin A, oder jede andere Struktur sein.

Transmembrane helices sind gewöhnlich ungefähr 20 Aminosäuren in der Länge, obwohl sie viel länger oder kürzer sein können.

Identifizierung von transmembrane helices

Transmembrane helices sind in Strukturen von durch die Röntgenstrahl-Beugung bestimmten Membranenproteinen sichtbar. Sie können auch auf der Grundlage von Hydrophobicity-Skalen vorausgesagt werden. Weil das Interieur des bilayer und das Innere von den meisten Proteinen der bekannten Struktur hydrophob sind, wie man wagt, ist es eine Voraussetzung der Aminosäuren, die eine Membran dass sie abmessen, ebenso hydrophob sein. Jedoch enthalten Membranenpumpen und Ion-Kanäle auch zahlreiche beladene und polare Rückstände innerhalb der allgemein nichtpolaren transmembrane Segmente.

Mit hydrophobicity Analyse, um transmembrane vorauszusagen, ermöglicht helices eine Vorhersage der Reihe nach "transmembrane Topologie" eines Proteins; d. h. Vorhersage dessen, was Teile davon in die Zelle herausstrecken, was Teile herausstrecken, und wie oft die Protein-Kette die Membran durchquert. Solche Vorhersagemethoden werden mit einem beschränkten Erfolg allgemein angewandt.

Transmembrane Online-Vorhersagealgorithmus-Server werden durch Expasy http://ca.expasy.org/tools/ unter der Topologie-Vorhersage verzeichnet. Die resultierenden Vorhersagen unterscheiden sich häufig und sollten mit der Verwarnung verwendet werden.