Ein oligonucleotide (vom griechischen Präfix oligo-, "wenige habend, wenig" habend), ist ein kurzes Nukleinsäure-Polymer normalerweise mit fünfzig oder weniger Basen. Obwohl sie durch die Band-Spaltung von längeren Segmenten gebildet werden können, werden sie jetzt, auf eine mit der Folge spezifische Weise, von individuellem nucleoside phosphoramidites allgemeiner synthetisiert. Automatisierte Synthesizer erlauben die Synthese von oligonucleotides bis zu ungefähr 200 Basen.

Oligonucleotides werden durch die Folge von nucleotide Rückständen charakterisiert, die das komplette Molekül umfassen. Die Länge des oligonucleotide wird gewöhnlich durch "mer" (von griechischem meros, "Teil") angezeigt. Zum Beispiel würde ein Bruchstück von 25 Basen einen 25-mer genannt. Oligonucleotides verpflichten sogleich, auf eine mit der Folge spezifische Weise, zu ihrem jeweiligen ergänzenden oligonucleotides, DNA oder RNS, duplexes oder, weniger häufig, Hybriden einer höheren Ordnung zu bilden. Dieses grundlegende Eigentum dient als ein Fundament für den Gebrauch von oligonucleotides als Untersuchungen, um DNA oder RNS zu entdecken. Beispiele von Verfahren, die oligonucleotides verwenden, schließen DNA-Mikroreihe, Südliche Kleckse, ASO Analyse, Leuchtstoff-in der situ Kreuzung (FISH) und die Synthese von künstlichen Genen ein. Oligonucleotides sind auch unentbehrliche Elemente in der Antisinngentherapie.

Oligonucleotides hat von 2 '-deoxyribonucleotides (oligodeoxyribonucleotides) gedichtet sind Bruchstücke der DNA und werden häufig in der polymerase Kettenreaktion, ein Verfahren verwendet, das fast jeden kleinen Betrag der DNA außerordentlich verstärken kann. Dort wird der oligonucleotide eine Zündvorrichtung genannt, DNA polymerase erlaubend, den oligonucleotide zu erweitern und das Ergänzungsufer zu wiederholen.

Synthese

Oligonucleotides werden mit Bausteinen chemisch synthetisiert, hat phosphoramidites von natürlichem oder chemisch modifiziertem nucleosides oder in einem kleineren Ausmaß von Non-Nucleosidic-Zusammensetzungen geschützt. Der oligonucleotide Kettenzusammenbau geht in der Richtung von 3 '-bis 5 '-Endstation durch den folgenden ein alltägliches als ein "synthetischer Zyklus gekennzeichnetes Verfahren" weiter. Die Vollziehung eines einzelnen synthetischen Zyklus läuft auf die Hinzufügung eines nucleotide Rückstands zur wachsenden Kette hinaus. Ein weniger als 100 % Ertrag jedes synthetischen Schritts und das Ereignis von Seitenreaktionen legen praktische Grenzen der Leistungsfähigkeit des Prozesses fest, so dass die maximale Länge von synthetischem oligonucleotides kaum 200 nucleotide Rückstände überschreitet. HPLC und andere Methoden können verwendet werden, um Produkte mit der gewünschten Folge zu isolieren

Antisinn oligonucleotides

Antisinn oligonucleotides ist einzelne Ufer der DNA oder RNS, die zu einer gewählten Folge ergänzend sind. Im Fall von der Antisinn-RNS verhindern sie Protein-Übersetzung von bestimmten Bote-RNS-Ufern, indem sie zu ihnen binden. Antisinn-DNA kann verwendet werden, um einen spezifischen, ergänzendes (das Codieren oder Nichtcodieren) RNS ins Visier zu nehmen. Wenn Schwergängigkeit Plätze nimmt, kann diese Hybride der DNA/RNS durch das Enzym RNase H erniedrigt werden.

DNA-Mikroreihe

Ein Subtyp der DNA-Mikroreihe kann als Substrate beschrieben werden (Nylonstrümpfe, Glas, usw.), zu dem oligonucleotides an der hohen Speicherdichte gebunden worden sind. Es gibt mehrere Anwendungen der DNA-Mikroreihe innerhalb der Lebenswissenschaften.

Siehe auch

• Aptamer — oligonucleotides mit wichtigen biologischen Anwendungen
• Morpholino — oligos mit dem nichtnatürlichen Rückgrat, das RNase-H nicht aktiviert, aber Genausdruck reduzieren oder RNS modifizieren kann, die spleißt
• Polymorphism — das Äußere in einer Bevölkerung desselben Gens in vielfachen Formen wegen Veränderungen; kann häufig mit ASO Untersuchungen geprüft werden
• Unterschrift von Genomic
• Polynucleotide
• CpG Oligodeoxynucleotide - ein ODN mit immunostimulatory Eigenschaften
• K-mer

Links

• RNAi Atlas: Eine Datenbank von RNAi Bibliotheken und ihrer Zielanalyse resultiert
• physorg.com hat die Genetische Quelle der Muskeldystrophie für neutral erklärt
• Oligonucleotides als Rauschgifte
• Dringen Sie "GENETIK ein: Eine Begriffsannäherung", 2005
• Weiss, B. (Hrsg.).: Antisinn Oligodeoxynucleotides und Antisinn-RNS: Neuartige Pharmakologische und Therapeutische Agenten, CRC Presse, Boca Raton, Florida, 1997
• Weiss, B., Davidkova, G., und Zhou, L-W.: Antisinn-RNS-Gentherapie, um biologische Prozesse zu studieren und abzustimmen. Zelle. Mol. Leben Sci. 55:334-358, 1999
• Hartwell, L. H., Motorhaube, L., Goldberg, M. L., Reynolds, A. E., Silber, L. M. und Veres, R. C. 2008. In: Genetik von Genen bis Genome 3. Ausgabe. Seiten. G-14.