Eine DNA-Mikroreihe (auch allgemein bekannt als Genspan, DNA-Span oder biochip) ist eine Sammlung von mikroskopischen einer festen Oberfläche beigefügten DNA-Punkten. Wissenschaftler verwenden DNA-Mikroreihe, um die Ausdruck-Niveaus der großen Anzahl von Genen gleichzeitig oder zum Genotypen vielfache Gebiete eines Genoms zu messen. Jeder DNA-Punkt enthält picomoles (10 Maulwürfe) einer spezifischen DNA-Folge, die als Untersuchungen (oder Reporter) bekannt ist. Diese können eine kurze Abteilung eines Gens oder anderen DNA-Elements sein, die verwendet werden, um einen cDNA oder cRNA Probe (genannt Ziel) unter Bedingungen der hohen Strenge zu kreuzen. Untersuchungsziel-Kreuzung wird gewöhnlich entdeckt und durch die Entdeckung von fluorophore-, Silber - oder Chemilumineszenz-etikettierte Ziele gemessen, um Verhältnisüberfluss an Nukleinsäure-Folgen im Ziel zu bestimmen.

Die grundlegende Mikroreihe

Da eine Reihe Zehntausende von Untersuchungen enthalten kann, kann ein Mikroreihe-Experiment viele genetische Tests in der Parallele vollbringen. Deshalb hat Reihe viele Typen der Untersuchung drastisch beschleunigt. In der Standardmikroreihe werden die Untersuchungen synthetisiert und dann über die Oberflächentechnik einer festen Oberfläche durch ein covalent Band zu einer chemischen Matrix (über Epoxydharz-silane, amino-silane, lysine, polyacrylamide oder andere) beigefügt. Die feste Oberfläche kann Glas-sein oder ein Siliziumchip, in welchem Fall sie als ein Span von Affy umgangssprachlich bekannt sind, wenn ein Span von Affymetrix verwendet wird. Andere Mikroreihe-Plattformen, wie Illumina, verwenden mikroskopische Perlen statt der großen festen Unterstützung. Wechselweise kann Mikroreihe durch die direkte Synthese von Oligonucleotide-Untersuchungen auf festen Oberflächen gebaut werden. DNA-Reihe ist von anderen Typen der Mikroreihe nur darin sie verschieden entweder misst DNA oder verwendet DNA als ein Teil seines Entdeckungssystems.

DNA-Mikroreihe kann verwendet werden, um Änderungen in Ausdruck-Niveaus zu messen, einzelnen nucleotide polymorphisms (SNPs), oder zum Genotypen oder den Wiederfolge-Mutationsgenomen zu entdecken (sieh Gebrauch- und Typ-Abteilung). Mikroreihe unterscheidet sich auch in Herstellung, Tätigkeit, Genauigkeit, Leistungsfähigkeit und kostet (sieh Herstellungsabteilung). Zusätzliche Faktoren für Mikroreihe-Experimente sind der Versuchsplan und die Methoden, die Daten zu analysieren (sieh Abteilung von Bioinformatics).

Geschichte

Mikroreihe-Technologie hat sich vom Südlichen Beflecken entwickelt, wo gebrochene DNA einem Substrat beigefügt und dann mit einem bekannten Gen oder Bruchstück untersucht wird. Der erste berichtete Gebrauch dieser Annäherung war die Analyse 378 hat lysed Bakterienkolonien jeder geordnet, eine verschiedene Folge beherbergend, die in vielfachen Repliken für den Ausdruck der Gene im vielfachen normal und Geschwulst-Gewebe geprüft wurden. Das wurde zur Analyse von mehr als 4000 menschlichen Folgen mit dem gesteuerten Computer ausgebreitet scannend und Image, das für die quantitative Analyse der Folgen in menschlichen colonic Geschwülsten und normalem Gewebe und dann zum Vergleich von colonic Geweben an der verschiedenen genetischen Gefahr in einer Prozession geht. Der Gebrauch einer Sammlung der verschiedenen DNA in der Reihe für den Kopierfräs-Ausdruck wurde auch 1987 beschrieben, und die geordnete DNA wurde verwendet, um Gene zu identifizieren, deren Ausdruck durch das Interferon abgestimmt wird. Diese frühe Genreihe wurde durch das Entdecken cDNAs auf Filterpapier mit einem Nadel entdeckenden Gerät gemacht. Der Gebrauch der miniaturisierten Mikroreihe für den Kopierfräs-Genausdruck wurde zuerst 1995 berichtet, und ein ganzes eukaryotic Genom (Saccharomyces cerevisiae) auf einer Mikroreihe wurde 1997 veröffentlicht.

Grundsatz

Der Kerngrundsatz hinter der Mikroreihe ist Kreuzung zwischen zwei DNA-Ufern, das Eigentum von Ergänzungsnukleinsäure-Folgen, sich mit einander durch das Formen von Wasserstoffobligationen zwischen ergänzendem nucleotide spezifisch zu paaren, stützen Paare. Eine hohe Zahl von Ergänzungsgrundpaaren in einer nucleotide Folge bedeutet dichteren non-covalent, der zwischen den zwei Ufern verpfändet. Nach der Wäsche von nichtspezifischer Abbinden-Folgen werden nur stark paarweise angeordnete Ufer gekreuzt bleiben. So erzeugen Leuchtstoff-etikettierte Zielfolgen, die zu einer Untersuchungsfolge binden, ein Signal, das in großer Zahl von der Kreuzung abhängt, die durch die Zahl von paarweise angeordneten Basen, die Kreuzungsbedingungen (wie Temperatur) bestimmt ist, und sich nach der Kreuzung waschend. Die Gesamtkraft des Signals, von einem Punkt (Eigenschaft), hängt vom Betrag der Zielprobe ab, die zur Untersuchungsgegenwart auf diesem Punkt bindet. Mikroreihe verwendet relativen quantization, in dem die Intensität einer Eigenschaft im Vergleich zur Intensität derselben Eigenschaft unter einer verschiedenen Bedingung ist, und die Identität der Eigenschaft durch seine Position bekannt ist.

Gebrauch und Typen

Viele Typen der Reihe bestehen, und die breiteste Unterscheidung ist, ob sie auf einer Oberfläche oder auf codierten Perlen räumlich eingeordnet werden:

• Die traditionelle fest-phasige Reihe ist eine Sammlung von regelmäßigen mikroskopischen "Punkten", genannt Eigenschaften, jeden mit einer spezifischen Untersuchung, die einer festen Oberfläche, solch so beigefügt ist, Glas-, Plastik oder Silikon biochip (allgemein bekannt wie ein Genom-Span, DNA-Span oder Genreihe). Tausende von ihnen können in bekannte Positionen auf einer einzelnen DNA-Mikroreihe gelegt werden.
• Die alternative Perlenreihe ist eine Sammlung von mikroskopischen Polystyrol-Perlen, jedem mit einer spezifischen Untersuchung und einem Verhältnis von zwei oder mehr Färbemitteln, die die auf der Zielfolge verwendeten Leuchtstofffärbemittel nicht stören.

DNA-Mikroreihe kann verwendet werden, um DNA (als in der vergleichenden genomic Kreuzung) zu entdecken, oder RNS zu entdecken (meistens als cDNA nach der Rückabschrift), der kann oder in Proteine nicht übersetzt werden darf. Der Prozess des Messgenausdrucks über cDNA wird Ausdruck-Analyse oder Kopierfräs-Ausdruck genannt.

Anwendungen schließen ein:

Herstellung

Mikroreihe kann unterschiedlich, abhängig von der Zahl von Untersuchungen unter der Überprüfung, den Kosten, den Anpassungsvoraussetzungen und dem Typ der wissenschaftlichen Frage verfertigt werden, die wird fragt. Reihe kann nur 10 Untersuchungen oder bis zu 2.1 Millionen Untersuchungen der Mikrometer-Skala von kommerziellen Verkäufern haben.

Entdeckt gegen in situ hat Reihe aufgebaut

Mikroreihe kann mit einer Vielfalt von Technologien, einschließlich des Druckes mit fein-zackigen Nadeln auf das Glasgleiten, Fotolithographie mit vorgemachten Masken, Fotolithographie mit dynamischen Mikrospiegelgeräten, Tintenstrahldruck oder Elektrochemie auf der Mikroelektrode-Reihe fabriziert werden.

In der entdeckten Mikroreihe sind die Untersuchungen oligonucleotides, cDNA oder kleine Bruchstücke von PCR Produkten, die mRNAs entsprechen. Die Untersuchungen werden vor der Absetzung auf der Reihe synthetisiert erscheinen und werden dann auf das Glas "entdeckt". Eine einheitliche Methode verwertet eine Reihe von feinen Nadeln oder Nadeln, die von einem robotic Arm kontrolliert sind, der in Bohrlöcher getaucht wird, die DNA-Untersuchungen enthalten und dann jede Untersuchung an benannten Positionen auf der Reihe-Oberfläche ablegen. Der resultierende "Bratrost" von Untersuchungen vertritt die Nukleinsäure-Profile der bereiten Untersuchungen und ist bereit, ergänzenden cDNA zu erhalten, oder cRNA "Ziele" ist auf experimentelle oder klinische Proben zurückzuführen gewesen.

Diese Technik wird von Forschern um die Welt verwendet, "um innerbetriebliche" gedruckte Mikroreihe von ihren eigenen Laboratorien zu erzeugen. Diese Reihe kann für jedes Experiment leicht kundengerecht angefertigt werden, weil Forscher die Untersuchungen und Druckpositionen auf der Reihe wählen, die Untersuchungen in ihrem eigenen Laboratorium (oder zusammenarbeitende Möglichkeit) synthetisieren, und die Reihe entdecken können. Sie können dann ihre eigenen etikettierten Proben für die Kreuzung erzeugen, die Proben zur Reihe kreuzen, und schließlich die Reihe mit ihrer eigenen Ausrüstung scannen. Das stellt eine relativ preisgünstige Mikroreihe zur Verfügung, die für jede Studie kundengerecht angefertigt werden kann, und die Kosten des Kaufens häufig teurerer kommerzieller Reihe vermeidet, die riesengroße Zahlen von Genen vertreten kann, die dem Ermittlungsbeamten nicht von Interesse sind.

Veröffentlichungen bestehen, die anzeigen, dass innerbetriebliche entdeckte Mikroreihe dasselbe Niveau der Empfindlichkeit im Vergleich zur kommerziellen Oligonucleotide-Reihe, vielleicht infolge der kleinen Gruppe-Größen und reduzierten Druckwirksamkeit nicht zur Verfügung stellen kann, wenn im Vergleich zu Industriefertigungen von oligo ordnet.

In der Oligonucleotide-Mikroreihe sind die Untersuchungen kurze Folgen, die entworfen sind, um Teile der Folge bekannter oder vorausgesagter offener Lesen-Rahmen zu vergleichen. Obwohl Oligonucleotide-Untersuchungen häufig in "der entdeckten" Mikroreihe verwendet werden, bezieht sich der Begriff "oligonucleotide Reihe" meistenteils auf eine spezifische Technik der Herstellung. Reihe von Oligonucleotide wird durch den Druck kurzer oligonucleotide Folgen erzeugt, die entworfen sind, um ein einzelnes Gen oder Familie von Genverbindungsvarianten durch das Synthetisieren dieser Folge direkt auf die Reihe-Oberfläche zu vertreten, anstatt intakte Folgen abzulegen. Folgen können (60-mer Untersuchungen wie das Design von Agilent) oder kürzer (25-mer Untersuchungen länger sein, die von Affymetrix erzeugt sind) abhängig vom gewünschten Zweck; längere Untersuchungen sind zu individuellen Zielgenen spezifischer, kürzere Untersuchungen können in der höheren Dichte über die Reihe entdeckt werden und sind preiswerter, um zu verfertigen.

Eine Technik, die verwendet ist, um Oligonucleotide-Reihe zu erzeugen, schließt Photosteindrucksynthese (Affymetrix) auf einem Kieselerde-Substrat ein, wo leichte und mit dem Licht empfindliche Verdeckenreagenzien verwendet werden, um eine Folge ein nucleotide auf einmal über die komplette Reihe "zu bauen". Jede anwendbare Untersuchung wird vor dem Baden der Reihe in einer Lösung eines einzelnen nucleotide auswählend "demaskiert", dann findet eine Verdeckenreaktion statt, und der folgende Satz von Untersuchungen werden in der Vorbereitung einer verschiedenen nucleotide Aussetzung demaskiert. Nach vielen Wiederholungen werden die Folgen jeder Untersuchung völlig gebaut. Mehr kürzlich hat die Maskless Reihe-Synthese von Systemen von NimbleGen Flexibilität mit der großen Anzahl von Untersuchungen verbunden.

Zwei-Kanäle-gegen die Ein-Kanal-Entdeckung

Zweifarbenmikroreihe oder Zwei-Kanäle-Mikroreihe werden normalerweise mit von zwei Proben bereitem cDNA gekreuzt (z.B krankes Gewebe gegen das gesunde Gewebe) verglichen zu werden, und die mit zwei verschiedenen fluorophores etikettiert werden. Für das CDNA-Beschriften allgemein verwendete Leuchtstofffärbemittel schließen Cy3 ein, der eine Fluoreszenz-Emissionswellenlänge von 570 nm (entsprechend dem grünen Teil des leichten Spektrums), und Cy5 mit einer Fluoreszenz-Emissionswellenlänge von 670 nm (entsprechend dem roten Teil des leichten Spektrums) hat. Der zwei Cy-Labeled cDNA Proben wird gemischt und zu einer einzelnen Mikroreihe gekreuzt, die dann in einem Mikroreihe-Scanner gescannt wird, um sich Fluoreszenz der zwei fluorophores nach der Erregung mit einem Laserbalken einer definierten Wellenlänge zu vergegenwärtigen. Verhältnisintensitäten jedes fluorophore können dann in der Verhältnis-basierten Analyse verwendet werden, um geregelte und unten geregelte Gene zu identifizieren.

Mikroreihe von Oligonucleotide trägt häufig Kontrolluntersuchungen haben vorgehabt, mit der RNS-Spitze-ins zu kreuzen. Der Grad der Kreuzung zwischen der Spitze-ins und den Kontrolluntersuchungen wird verwendet, um die Kreuzungsmaße für die Zieluntersuchungen zu normalisieren. Obwohl absolute Pegel des Genausdrucks in der Zweifarbenreihe in seltenen Beispielen bestimmt werden können, die Verhältnisunterschiede im Ausdruck unter verschiedenen Punkten innerhalb einer Probe und zwischen Proben ist die bevorzugte Methode der Datenanalyse für das Zweifarbensystem. Beispiele von Versorgern für solche Mikroreihe schließen Agilent mit ihrer Doppelweise-Plattform, Eppendorf mit ihrer Plattform von DualChip für das colorimetric Beschriften von Silverquant und TeleChem International mit Arrayit ein.

In der Mikroreihe des einzelnen Kanals oder einfarbigen Mikroreihe stellt die Reihe Intensitätsdaten für jeden Untersuchungs- oder Untersuchungssatz zur Verfügung, der ein Verhältnisniveau der Kreuzung mit dem etikettierten Ziel anzeigt. Jedoch zeigen sie Überfluss-Niveaus eines Gens, aber ziemlich relativen Überflusses wenn im Vergleich zu anderen Proben oder Bedingungen, wenn bearbeitet, in demselben Experiment nicht aufrichtig an. Jedes RNS-Molekül stößt auf Protokoll und mit der Gruppe spezifische Neigung während der Erweiterung, des Beschriftens und der Kreuzungsphasen der Experiment-Bilden-Vergleiche zwischen Genen für dieselbe uninformative Mikroreihe. Der Vergleich von zwei Bedingungen für dasselbe Gen verlangt zwei getrennte Kreuzungen des einzelnen Färbemittels. Mehrere populäre Systeme des einzelnen Kanals sind Affymetrix "Gene Chip", Illumina "Perle Chip", Reihe des einzelnen Kanals von Agilent, die Angewandte Mikroreihe "CodeLink" Reihe und Eppendorf "DualChip & Silverquant". Eine Kraft des Systems des einzelnen Färbemittels liegt in der Tatsache, dass eine abweichende Probe die rohen Daten nicht betreffen kann, ist auf andere Proben zurückzuführen gewesen, weil jeder Reihe-Span zu nur einer Probe ausgestellt wird (im Vergleich mit einem Zweifarbensystem, in dem eine einzelne Probe der niedrigen Qualität an die gesamte Datenpräzision drastisch stoßen kann, selbst wenn die andere Probe von hoher Qualität gewesen ist). Ein anderer Vorteil ist, dass Daten leichter im Vergleich zur Reihe von verschiedenen Experimenten sind, so lange Gruppe-Effekten verantwortlich gewesen worden sind. Ein Nachteil zum einfarbigen System ist das, wenn im Vergleich zum Zweifarbensystem doppelt so viele Mikroreihe erforderlich ist, um Proben innerhalb eines Experimentes zu vergleichen.

Mikroreihe und bioinformatics

Das Advent von billigen Mikroreihe-Experimenten hat mehrere spezifische Bioinformatics-Herausforderungen geschaffen:

• die vielfachen Niveaus der Erwiderung im Versuchsplan (Versuchsplan)
• die Zahl von Plattformen und unabhängigen Gruppen und Daten formatiert (Standardisierung)
• die Behandlung der Daten (Statistische Analyse)
• Genauigkeit und Präzision (Beziehung zwischen Untersuchung und Gen)
• das bloße Volumen von Daten und der Fähigkeit, es (Datenlagerung) zu teilen

Versuchsplan

Wegen der biologischen Kompliziertheit des Genausdrucks sind die Rücksichten des Versuchsplanes, die im Ausdruck-Artikel des im Profil darstellet besprochen werden, von kritischer Wichtigkeit, wenn statistisch und biologisch gültige Beschlüsse von den Daten gezogen werden sollen.

Es gibt drei Hauptelemente, um in Betracht zu ziehen, wenn es ein Mikroreihe-Experiment entwirft. Erstens ist die Erwiderung der biologischen Proben notwendig, um Schlüsse aus dem Experiment zu ziehen. Zweitens, technisch wiederholt (zwei RNS-Proben, die bei jeder experimentellen Einheit erhalten sind), helfen, Präzision zu sichern und Prüfung von Unterschieden innerhalb von Behandlungsgruppen zu berücksichtigen. Das biologische wiederholt schließen unabhängige RNS-Förderungen ein, und technisch wiederholt kann zwei Aliquoten derselben Förderung sein. Drittens sind Punkte jedes CDNA-Klons oder oligonucleotide da, wie (mindestens Duplikate) auf dem Mikroreihe-Gleiten wiederholt, um ein Maß der technischen Präzision in jeder Kreuzung zur Verfügung zu stellen. Es ist kritisch, dass die Information über die Beispielvorbereitung und das Berühren besprochen wird, um zu helfen, die unabhängigen Einheiten im Experiment zu identifizieren und aufgeblasene Schätzungen der statistischen Bedeutung zu vermeiden.

Standardisierung

Mikroreihe-Daten sind schwierig, wegen des Mangels an der Standardisierung in der Plattform-Herstellung, den Feinprobe-Protokollen und den Analyse-Methoden wert zu sein. Das wirft ein Zwischenfunktionsfähigkeitsproblem in bioinformatics auf. Verschiedene bodenständige Projekte der offenen Quelle versuchen, den Austausch und die Analyse von mit Nichteigentumschips erzeugten Daten zu erleichtern:

• Zum Beispiel, die "Minimale Information Über ein Mikroreihe-Experiment" (MIAME) Checkliste hilft, das Niveau des Details zu definieren, das bestehen sollte und durch viele Zeitschriften als eine Voraussetzung für die Vorlage von Papieren angenommen wird, die Mikroreihe-Ergebnisse vereinigen. Aber MIAME beschreibt das Format für die Information so nicht, während viele Formate die MIAME Voraussetzungen, keine Format-Erlaubnis-Überprüfung des ganzen semantischen Gehorsams unterstützen können.
• Die "Qualitätskontrolle von MicroArray (MAQC) Projekt" wird von der amerikanischen Bundesbehörde zur Überwachung von Nahrungs- und Arzneimittlel (FDA) geführt, um Standards und Qualitätskontrollmetrik zu entwickeln, die schließlich den Gebrauch von Daten von MicroArray in der Rauschgift-Entdeckung, klinischen Praxis und Durchführungsbeschlussfassung erlauben wird.
• Die MGED Gesellschaft hat Standards für die Darstellung von Genausdruck-Experiment-Ergebnissen und relevanten Anmerkungen entwickelt.

Statistische Analyse

Mikroreihe-Dateien sind allgemein sehr große und analytische Präzision ist unter Einfluss mehrerer Variablen. Statistische Herausforderungen schließen in Betracht ziehende Effekten des Nebengeräuschs ein und verwenden Normalisierung der Daten. Normalisierungsmethoden kann spezifischen Plattformen und im Fall von kommerziellen Plattformen angepasst werden, die Analyse kann Eigentums-sein. Algorithmen, die statistische Analyse betreffen, schließen ein:

• Bildanalyse: gridding, Punkt-Anerkennung des gescannten Images (Segmentationsalgorithmus), Eliminierung oder Markierung von Eigenschaften der schlechten Qualität und niedrigen Intensität (genannt Platten).
• Datenverarbeitung: Hintergrundsubtraktion (gestützt auf dem globalen oder lokalen Hintergrund), Entschluss von Punkt-Intensitäten und Intensitätsverhältnissen, Visualisierung von Daten (sieh z.B Magister artium sich verschwören), und Klotz-Transformation von Verhältnissen, globale oder lokale Normalisierung von Intensitätsverhältnissen und Segmentation in verschiedene Kopie-Zahl-Gebiete mit Schritt-Entdeckungsalgorithmen.
• Identifizierung statistisch bedeutender Änderungen: T-Test, ANOVA, Methode von Bayesian Testmethoden von Mann-Whitney, die geschneidert sind, um Dateien mikrozuordnen, die vielfache Vergleiche oder Traube-Analyse in Betracht ziehen. Diese Methoden bewerten statistische Macht, die auf der Schwankungsgegenwart in den Daten gestützt ist, und die Zahl von experimentellen wiederholt und kann helfen, Typ I und Fehler des Typs II in den Analysen zu minimieren.
• Netzbasierte Methoden: Statistische Methoden, die die zu Grunde liegende Struktur von Gennetzen in Betracht ziehen, entweder assoziative oder begründende Wechselwirkungen oder Abhängigkeiten unter Genprodukten vertretend.

Mikroreihe-Daten können verlangen, dass weitere Verarbeitung darauf gezielt hat, den dimensionality der Daten zu reduzieren, um Verständnis und mehr eingestellter Analyse zu helfen. Andere Methoden erlauben, dass die Analyse von Daten, die aus einer niedrigen Zahl von biologischen oder technischen bestehen, wiederholt; zum Beispiel vereint der Test von Local Pooled Error (LPE) Standardabweichungen von Genen mit ähnlichen Ausdruck-Niveaus, um die ungenügende Erwiderung zu ersetzen.

Beziehung zwischen Untersuchung und Gen

Die Beziehung zwischen einer Untersuchung und dem mRNA, den, wie man erwartet, es entdeckt, ist nicht trivial. Ein mRNAs kann Untersuchungen in der Reihe quer-kreuzen, die einen anderen mRNA entdecken sollen. Außerdem kann mRNAs Erweiterungsneigung erfahren, die Folge oder mit dem Molekül spezifisch ist. Drittens können sich Untersuchungen, die entworfen werden, um den mRNA eines besonderen Gens zu entdecken, auf genomic EST Information verlassen, die mit diesem Gen falsch vereinigt wird.

Datenlagerung

Wie man

fand, waren Mikroreihe-Daten wenn im Vergleich zu anderem ähnlichem datasets nützlicher. Das bloße Volumen von Daten, spezialisierte Formate (wie MIAME), und curation mit dem datasets vereinigte Anstrengungen verlangt, dass spezialisierte Datenbanken die Daten versorgen.

Siehe auch

• Färbemittel von Cyanine, wie Cy3 und Cy5, werden fluorophores mit der Mikroreihe allgemein verwendet
• Mikroreihe-Protokolle
• Volles Genom Sequencing
• Genspan-Analyse
• Mikroströmungslehre oder Laboratorium auf dem Span
• Pathogenomics
• Serienanalyse des Genausdrucks
• Bedeutungsanalyse der Mikroreihe
• Systembiologie

Wörterverzeichnis

• Eine Reihe oder Gleiten sind eine Sammlung von Eigenschaften, die räumlich in einem zwei dimensionalen Bratrost eingeordnet sind, der in Säulen und Reihen eingeordnet ist.
• Block oder Subreihe: Eine Gruppe von Punkten, die normalerweise in einem Druck herum gemacht sind; mehrere Subreihe/Blöcke bildet eine Reihe.
• Fall/Kontrolle: Ein Versuchsplan-Paradigma hat besonders zum Zweifarbenreihe-System gepasst, in dem eine Bedingung, die als Kontrolle (wie gesundes Gewebe oder Staat) gewählt ist, im Vergleich zu einer veränderten Bedingung (wie ein krankes Gewebe oder Staat) ist.
• Kanal: Die Fluoreszenz-Produktion, die im Scanner für einen individuellen fluorophore registriert ist, und kann sogar ultraviolett sein.
• Färbemittel-Flip oder Färbemittel-Tausch oder Umkehrung von Fluor: Das gegenseitige Beschriften der DNA nimmt mit den zwei Färbemitteln ins Visier, um für Färbemittel-Neigung in Experimenten verantwortlich zu sein.
• Scanner: Ein Instrument hat gepflegt, die Intensität der Fluoreszenz von Punkten auf einem Mikroreihe-Gleiten, durch auswählend aufregenden fluorophores mit einem Laser und dem Messen der Fluoreszenz mit einem Filter (Optik) Photovermehrer-System zu entdecken und zu messen.
• Punkt oder Eigenschaft: Ein kleines Gebiet auf einem Reihe-Gleiten, das picomoles von spezifischen DNA-Proben enthält.
• Weil andere relevante Begriffe sehen:

:Glossary des Genausdrucks nennt

:Protocol (Naturwissenschaften)

Außenverbindungen

• Viele wichtige Verbindungen können am Offenen Verzeichnisprojekt gefunden werden
• Biologie-Zündvorrichtung von PLoS: Mikroreihe-Analyse
• Bericht der Mikroreihe-Technologie
• ArrayMining.net - ein freier Webserver für die Online-Mikroreihe-Analyse
• CLASSIFI - Gen Ontologie-basierte Gentraube-Klassifikationsquelle
• Mikroreihe - Wie arbeitet es?
• Was DNA-Mikroreihe - eine Nichtbiologe-Einführung in die Mikroreihe ist
• Das in einer Prozession gehende Mikroreihe-Datenverwenden, das Karte-Tutorenkurs Selbstorganisiert: Teil 2 des Teils 1
• PNAS Kommentar: Entdeckung von Grundsätzen der Natur vom mathematischen Modellieren von DNA-Mikroreihe-Daten