In der organischen Chemie ist ein heteroatom (von Alten griechischen Heteros, verschieden, + atomos) jedes Atom, das nicht Kohlenstoff oder Wasserstoff ist. Gewöhnlich wird der Begriff gebraucht, um anzuzeigen, dass Nichtkohlenstoff-Atome Kohlenstoff im Rückgrat der molekularen Struktur ersetzt haben. Typische heteroatoms sind Stickstoff, Sauerstoff, Schwefel, Phosphor, Chlor, Brom und Jod.

In der Beschreibung der Protein-Struktur, insbesondere im Protein-Datenbankdateiformat, beschreibt eine Heteroatom-Aufzeichnung (HETATM) ein Atom als das Gehören einem kleinen Molekül cofactor aber nicht ein Teil einer biopolymer Kette zu sein.

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• Zeitschrift - Heteroatom Chemie