Ligase

In der Biochemie, ligase (vom lateinischen Verb ligāre - "um" zu verpflichten, oder, "zusammen" zu kleben), ist ein Enzym, das das Verbinden von zwei großen Molekülen durch das Formen eines neuen chemischen Bandes, gewöhnlich mit der Begleithydrolyse eines kleinen chemischen Gruppenabhängigen zu einem der größeren Moleküle oder des Enzyms katalysieren kann, das die Verbindung zusammen zwei Zusammensetzungen.... z.B katalysiert: Enzyme, die das Verbinden von C-O, C-S, C-N usw..In allgemein, ein ligase katalysieren, katalysieren die folgende Reaktion:

:Ab + C  A-C + b

oder manchmal

:Ab + cD  A-D + b + c

wo die Kleinbuchstaben die kleinen, abhängigen Gruppen bedeuten.

Nomenklatur

Die gemeinsamen Bezeichnungen von ligase Enzymen schließen häufig das Wort "ligase", wie DNA ligase, ein in molekularen Biologie-Laboratorien allgemein verwendetes Enzym ein, um DNA-Bruchstücke zusammenzutreffen. Andere gemeinsame Bezeichnungen für ligases schließen synthetases ein, weil sie verwendet werden, um neue Moleküle zu synthetisieren.

Bemerken Sie, dass, ursprünglich, biochemische Nomenklatur synthetases und synthases unterschieden hat. Laut der ursprünglichen Definition verwenden synthases Energie von nucleoside triphosphates nicht (wie ATP, GTP, CTP, TTP und UTP), wohingegen synthetases wirklich nucleoside triphosphates verwenden. Es wird auch gesagt, dass ein synthase ein lyase ist (ein lyase ist ein Enzym, das das Brechen von verschiedenen chemischen Obligationen durch Mittel außer der Hydrolyse und Oxydation katalysiert, häufig eine neue Doppelbindung oder eine neue Ringstruktur bildend), und keine Energie verlangt, wohingegen ein synthetase ein ligase ist (ein ligase ist ein Enzym, das zwei Chemikalien oder Zusammensetzungen bindet) und so Energie verlangt. Jedoch diktiert die Gemeinsame Kommission auf der Biochemischen Nomenklatur (JCBN), dass 'synthase' mit jedem Enzym verwendet werden kann, das Synthese katalysiert (ob es nucleoside triphosphates verwendet), wohingegen 'synthetase' synonymisch verwendet werden soll.

Klassifikation

Ligases werden als die EG 6 in der Zahl-Klassifikation der europäischen Gemeinschaft von Enzymen klassifiziert. Ligases kann weiter in sechs Unterklassen eingeteilt werden:

  • schließt ligases ein, der verwendet ist, um Obligationen des Kohlenstoff-Sauerstoffes zu bilden
  • schließt ligases ein, der verwendet ist, um Obligationen des Kohlenstoff-Schwefels zu bilden
  • schließt ligases ein, der verwendet ist, um Obligationen des Kohlenstoff-Stickstoffs (einschließlich argininosuccinate synthetase) zu bilden
  • schließt ligases ein, der verwendet ist, um Obligationen des Kohlenstoff-Kohlenstoff zu bilden
  • schließt ligases ein, der verwendet ist, um phosphorige ester Obligationen zu bilden
  • schließt ligases ein, der verwendet ist, um mit dem Stickstoff metallene Obligationen zu bilden

Siehe auch

Links


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