Seiten von CpG oder CG-Seiten sind Gebiete der DNA, wo ein cytosine nucleotide neben einem guanine nucleotide in der geradlinigen Folge von Basen entlang seiner Länge vorkommt. "CpG" ist Schnellschrift für "— C — Phosphat — G —", d. h. cytosine und durch nur ein Phosphat getrennter guanine; Phosphat verbindet irgendwelche zwei nucleosides zusammen in der DNA. Die "CpG" Notation wird verwendet, um diese geradlinige Folge von der CG-Grundpaarung von cytosine und guanine zu unterscheiden.

Cytosines in CpG dinucleotides kann methylated sein, um sich 5-methylcytosine zu formen. In Säugetieren, methylating der cytosine innerhalb eines Gens kann das Gen, ein Mechanismus abdrehen, der ein Teil eines größeren Feldes der Wissenschaft ist, die Genregulierung studiert, die epigenetics genannt wird. Enzyme, die eine Methyl-Gruppe hinzufügen, werden DNA methyltransferases genannt.

In Säugetieren sind 70 % bis 80 % von CpG cytosines methylated.

Unmethylated Seiten von CpG kann durch den einer Gebühr ähnlichen Empfänger 9 (TLR 9) auf plasmacytoid dendritic Zellen und B Zellen in Menschen entdeckt werden. Das wird verwendet, um intrazelluläre und pathogen Virenpilzbakterien-DNA zu entdecken.

Frequenz in Wirbeltieren

lange beobachtet hat, sind CpG dinucleotides mit einer viel niedrigeren Frequenz in der Folge von Wirbelgenomen vorgekommen, als es wegen der zufälligen Chance erwartet würde. Zum Beispiel, im menschlichen Erbgut, das einen GC 42-%-Inhalt hat, wie man erwarten würde, kam ein Paar von nucleotides, der aus von guanine gefolgtem cytosine besteht, 0.21 * 0.21 = 4.41 % der Zeit vor. Die Frequenz von CpG dinucleotides in menschlichen Genomen ist 1 % - weniger als ein Viertel der erwarteten Frequenz. Scarano. hat vorgeschlagen, dass der Mangel von CpG wegen einer vergrößerten Verwundbarkeit von methylcytosines zu spontan deaminate zu thymine in Genomen mit CpG cytosine methylation ist.

Inseln von CpG

Es gibt Gebiete des Genoms, die eine höhere Konzentration von Seiten von CpG haben, die als Inseln von CpG bekannt sind. Viele Gene in Säugetiergenomen ließen Inseln von CpG mit dem Anfang des Gens vereinigen. Wegen dessen wird die Anwesenheit einer Insel von CpG verwendet, um in der Vorhersage und Anmerkung von Genen zu helfen.

Methylation, und Krebs zum Schweigen zu bringen

Methylation von Seiten von CpG innerhalb der Befürworter von Genen kann dazu führen, dass sie, eine Eigenschaft zum Schweigen bringen, die in mehreren menschlichen Krebsen (zum Beispiel gefunden ist von Geschwulst-Entstörgerät-Genen zum Schweigen zu bringen). Im Gegensatz ist der hypomethylation von Seiten von CpG mit dem Überausdruck von oncogenes innerhalb von Krebs-Zellen vereinigt worden.

Siehe auch

• CpG Oligodeoxynucleotide
• TLR9, Entdecker von unmethylated Seiten von CpG