SH3 Gebiet

Die SRC Homologie 3 Gebiet (oder SH3 Gebiet) ist ein kleines Protein-Gebiet von ungefähr 60 Aminosäure-Rückständen, die zuerst als eine erhaltene Folge im Virenadapter-Protein v-Crk und den nichtkatalytischen Teilen von Enzymen wie phospholipase und mehrere cytoplasmic tyrosine kinases wie Abl und Src identifiziert sind. Es ist auch in mehreren anderen Protein-Familien identifiziert worden wie: PI3 Kinase, Ras GTPase das Aktivieren des Proteins, CDC24 und cdc25. SH3 Gebiete werden in Proteinen von Signalpfaden gefunden, die den cytoskeleton, das Protein von Ras, und Src kinase und viele andere regeln. Sie regeln auch die Aktivierungszustand von Adapter-Proteinen und anderem tyrosine kinases und werden gedacht, die Substrat-Genauigkeit von einem tyrosine kinases durch die Schwergängigkeit weit weg von der aktiven Seite des kinase zu vergrößern. Etwa 300 SH3 Gebiete werden in im menschlichen Erbgut verschlüsselten Proteinen gefunden.

Struktur

Das SH3 Gebiet hat eine charakteristische Falte des Beta-Barrels, die aus fünf oder sechs β-strands eingeordnet als zwei dicht gepackte Antiparallele β Platten besteht. Die linker Gebiete können kurzen helices enthalten. Die SH3-Typ-Falte ist eine alte Falte, die in eukaryotes sowie prokaryotes gefunden ist.

Schwergängigkeit von Peptide

Das klassische SH3 Gebiet wird gewöhnlich in Proteinen gefunden, die mit anderen Proteinen und mittelbarem Zusammenbau von spezifischen Protein-Komplexen normalerweise über die Schwergängigkeit zu pro-linien-reichem peptides in ihrem jeweiligen verbindlichen Partner aufeinander wirken. Klassische SH3 Gebiete werden in Menschen auf intrazelluläre Proteine eingeschränkt, obwohl die kleine menschliche MIA Familie von extracellular Proteinen auch ein Gebiet mit einer SH3 ähnlichen Falte enthält.

Viele, epitopes Proteine SH3-bindend, haben eine Einigkeitsfolge:

- X P p X P -

1 2 3 4 5

mit 1 und 4, aliphatic Aminosäuren, 2 und 5 immer seiend und manchmal Pro-Linie 3 zu sein. Die Folge bindet zur hydrophoben Tasche des SH3 Gebiets. Mehr kürzlich sind SH3 Gebiete, die zu einem Kerneinigkeitsmotiv R x x K binden, beschrieben worden. Beispiele sind die Gebiete des C-Terminals SH3 von Adapter-Proteinen wie Grb2 und Mona (a.k.a. Zacken, Grap2, Grf40, GrpL usw.). Anderer SH3 sind verbindliche Motive erschienen und erscheinen noch im Laufe verschiedener molekularer Studien, die Vielseitigkeit dieses Gebiets hervorhebend.

Proteine mit dem SH3 Gebiet

  • Adapter-Proteine
  • CDC24
  • Cdc25
  • PI3 kinase
  • Phospholipase
  • Ras GTPase das Aktivieren des Proteins
  • Vav proto-oncogene
  • GRB2
  • p54 S6 kinase 2 (S6K2)

Siehe auch

  • Homologie von Src 2 bereichsenthaltender
  • Strukturgebiet

Links


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